Desde el año 2000, la Certificación en Turismo Sostenible Smart Voyager Agua contribuye para generar cambios en el manejo de las embarcaciones turísticas  de Galápagos, especialmente en lo relacionado con la disminución de los impactos negativos del turismo.

A partir de su reconocimiento por la UNESCO en 2002 como un ejemplo a ser implementado en todos los patrimonios naturales de la humanidad, el programa Smart Voyager se proyecta como un referente en cuanto a turismo sostenible.

Para el viajero, el programa  de Smart Voyager significa protección a la vida silvestre y el entorno natural, mejores condiciones de vida para los habitantes de las islas y de los empleados relacionados a la operación, equipos turísticos capacitados en el tema socio ambiental.

La certificación observa temas fundamentales como fuentes de contaminación, buen manejo de muelles, embarcaciones, control de especies exóticas así como  mejores condiciones y capacitación para la tripulación de los barcos.

En la actualidad, esta certificación creada por la organización Conservación & Desarrollo (C&D), es miembro fundador de la Red de Certificación de Turismo Sostenible de las Américas.